A公司为创新层公司，其最近有成交的60个做市转让日的平均市值为3

Ⅰ、Ⅱ两项正确，《全国中小企业股份转让系统挂牌公司分层管理办法》第10条规定，全国股转公司根据分层标准及维持标准，于每年4月30日启动挂牌公司所属层级的调整工作。基础层的挂牌公司，符合创新层条件的，调整进入创新层；不符合创新层维持条件的挂牌公司，调整进入基础层。全国股转公司可以根据分层管理的需要，适当提高或降低挂牌公司层级调整的频率。
　　Ⅲ项正确，第11条第1款规定，全国股转公司正式调整挂牌公司层级前，在全国股转系统官网公示进入基础层和创新层的挂牌公司名单。挂牌公司对分层结果有异议或者自愿放弃进入创新层的，应当在3个转让日内提出。全国股转公司可视异议核实情况调整分层结果。
　　Ⅳ项正确，是属于第7条第2项禁止情形，挂牌公司或其控股股东、实际控制人，现任董事、监事和高级管理人员因信息披露违规、公司治理违规、交易违规等行为被中国证监会及其派出机构采取行政监管措施或者被采取行政处罚，或者正在接受立案调查，尚未有明确结论意见，不得调整进入创新层；
　　Ⅴ项错误，第12条第3项规定，挂牌公司不符合创新层公司治理要求且“持续时间”达到3个月以上的，自该情形认定之日起20个转让日内直接调整至基础层。
　　故Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ项正确，选C。

A，根据规定，申请挂牌公司股票拟采取做市转让方式的，应当有2家以上做市商为其提供做市报价服务。其中一家做市商应为推荐其股票挂牌的主办券商或该主办券商的母(子)公司，子公司也是可以的。D，根据《全国中小企业股份转让系统股票转让细则(试行)》的规定，挂牌时采取做市转让方式的股票，初始做市商应当取得合计不低于挂牌公司总股本5％或100万股(以孰低为准)，且每家做市商不低于10万股的做市库存股票。

。深圳证券交易所选取成分股的一般原则是：（1)有一定的上市 交易时间；（2)有一定的上市规模，以每家公司一段时期内的平均可流通股市值和平均总 市值作为衡量标准；（3)交易活跃，以每家公司一段时期内的总成交金额和换手率作为衡 量标准。

Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ项，《全国中小企业股份转让系统挂牌公司分层管理办法（试行）》
（股转系统公告〔2016〕37号）第11条规定，进入创新层的挂牌公司应当满足以下维持条件之一：①最近两年连续盈利，且年平均净利润不少于1200万元（以扣除非经常性损益前后孰低者为计算依据）；最近两年加权平均净资产收益率平均不低于6%（以扣除非经常性损益前后孰低者为计算依据）。②最近两年营业收入连续增长，且年均复合增长率不低于30%；最近两年营业收入平均不低于4000万元；股本不少于2000万股。③最近有成交的60个做市转让日的平均市值不少于3.6亿元；最近一年年末股东权益不少于5000万元；做市商家数不少于6家。
Ⅴ项属于挂牌公司进入创新层的条件之一。第7条规定，根据第6条的规定进入创新层的挂牌公司，还应当满足的条件之一是：最近12个月完成过股票发行融资（包括申请挂牌同时发行股票），且融资额累计不低于1000万元；或者最近60个可转让日实际成交天数占比不低于50%。

Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三项，《全国中小企业股份转让系统挂牌公司分层管理办法（试行）》第11条规定，进入创新层的挂牌公司应当满足以下维持条件之一：
①最近两年连续盈利，且年平均净利润不少于1200万元（以扣除非经常性损益前后孰低者为计算依据）；最近两年加权平均净资产收益率平均不低于6%（以扣除非经常性损益前后孰低者为计算依据）。
②最近两年营业收入连续增长，且年均复合增长率不低于30%；最近两年营业收入平均不低于4000万元；股本不少于2000万股。
③最近有成交的60个做市转让日的平均市值不少于3.6亿元；最近一年年末股东权益不少于5000万元；做市商家数不少于6家。
Ⅳ、Ⅴ两项，第8条规定，第12条规定，进入创新层的挂牌公司除满足第11条规定的维持条件外，还应当满足以下条件：
①合格投资者不少于50人。
②最近60个可转让日实际成交天数占比不低于50%。
③公司治理符合第7条第2项的要求，且最近12个月不存在规定的情形。
④按照全国股转公司的要求，在会计年度结束之日起4个月内编制并披露年度报告；最近三个会计年度的财务会计报告被会计师事务所出具标准无保留意见的审计报告。
⑤全国股转公司规定的其他条件。

Ⅰ、Ⅳ两项，《全国中小企业股份转让系统股票转让方式确定及变更指引（试行）》第5条规定，股票挂牌时拟采取做市转让方式的，应当具备以下条件：①2家以上做市商同意为申请挂牌公司股票提供做市报价服务，且其中一家做市商为推荐该股票挂牌的主办券商或该主办券商的母（子）公司；②做市商合计取得不低于申请挂牌公司总股本5％或100万股（以孰低为准），且每家做市商不低于10万股的做市库存股票；③全国股份转让系统公司规定的其他条件。Ⅱ项，《全国中小企业股份转让系统股票转让细则（试行）》第37条规定，投资者买人的股票，买入当日不得卖出；做市商买入的股票，买入当日可以卖出。全国股份转让系统公司另有规定的除外。第68条规定，做市商当日从其他做市商处买入的股票，买入当日不得卖出。Ⅲ项，《全国中小企业股份转让系统股票转让细则（试行）》第58条规定，做市商证券自营账户不得持有其做市股票或参与做市股票的买卖。