无害通过制中潜水艇要浮出水面并悬挂国旗，在过境通行制中则不需要。

无害通过是指外国船舶在不损害沿海国和平安宁和正常秩序的条件下，拥有无须事先通知或征得沿海国许可而连续不断地通过其领海的航行权利。无害通过是任何国家都拥有的一项权利，沿海国不应对此进行妨碍。外国船舶也无须事先通知沿海国。因此A项中所述行为并未违反无害通过规则的要求。无害通过要求连续不停地迅速通过，不得停泊和下锚，但是遇有不可抗力、遇难和救助的情况除外。B项中的行为也未违反无害通过的要求。外国船舶的行为必须是无害的。有害行为包括以下一些情况：(1)对沿海国的主权、领土完整或政治独立进行任何武力威胁或使用武力，或以任何违反联合国宪章所体现的国际法原则的方式进行武力威胁或使用武力；(2)以任何种类的武器进行任何操练或演习；(3)任何目的在于搜集情报使沿海国的国防或安全受损害的行为；(4)任何目的在于影响沿海国防务或安全的宣传行为；(5)在船上起落或接载任何飞机；(6)在船上发射降落或接载任何军事装置；(7)违反沿海国海关、卫生、财政、移民的法律和规章，以及上下任何商品、货币或人员；(8)任何故意和严重的污染行为；(9)任何捕鱼行动；(10)进行研究或测量活动；(11)任何目的在于干扰沿海国通讯系统或其他任何设施或设备的行为；(12)与通过没有任何关系的其他任何活动。由此可知C、D两项中的“侦察活动”和“测量活动”都是违反无害通过规则的要求的行为。此外，潜水艇或其他潜水器通过领海必须浮出水面并展示其船旗。因此本题应选C、D两项。

过境通行不同于无害通行，无害通行只包括船舶在领海上的通行权利，而过境通行还包括飞机的飞行，过境通行不能暂停实施，潜水艇通过时无须上浮到水面和展示旗帜。