涉密工程这一概念来源于《中华人民共和国政府采购法》。

A项，政府采购合同适用《合同法》。采购人和供应商之间的权利和义务应当按照平等、自愿的原则以合同方式约定，合同应采用书面形式。BC两项，政府采购工程以及与工程建设有关的货物、服务，采用招标方式采购的适用《招标投标法》及其实施条例，由有关行政监督部门对招标投标实施监督，预算执行情况和政府采购政策执行情况由财政部门实施监督；采用其他方式采购的适用《政府采购法》及其实施条例，由财政部门实施监督。D项，政府采购方式包括公开招标、邀请招标、竞争性谈判、竞争性磋商、单一来源采购、询价和国务院政府采购监督管理部门认定的其他采购方式。公开招标是政府采购的主要方式。

B、C、D均不对。
B：财政部门依法对实行招标投标的政府采购工程建设的预算执行情况和政府采购政策执行情况实施监督。
C：政府采购例外情形：
1)使用国际组织和外国政府贷款进行的政府采购，贷款方、资金提供方与中方达成的协议对采购的具体条件另有规定的，可以适用其规定，但不得损害国家利益和社会公共利益；
C：政府采购例外情形：
2)对因严重自然灾害和其他不可抗力事件所实施的紧急采购和涉及国家安全和秘密的采购；
3)军事采购法规由中央军事委员会另行制定。
D：政府采购采用以下方式：(一)公开招标；(二)邀请招标；(三)竞争性谈判；(四)单一来源采购；(五)询价；(六)国务院政府采购监督管理部门认定的其他采购方式。公开招标应作为政府采购的主要采购方式。