大部分的致畸因子来源于母体自身的内环境。

(1)致畸因子的含义致畸因子是指怀孕期间环境中的任何引起损害的因素，例如药物、孕妇患有的疾病以及有害环境等。(2)致畸因子的作用原理第一，致畸因子的影响有赖于机体的基因型。一种物质可能对某一种系有害，但是对另一种系却没有。某些个体对一种致畸因子的敏感性高于另外一些个体。第二，致畸因子在胎儿发展的不同时期，其影响会不同。接触致畸因子的时间非常重要。在受精卵阶段接触致畸因子通常会导致自然流产：在胚胎期则可能会导致身体结构的主要缺陷；在胎儿期既可能会导致身体结构的轻微缺陷，也可能会导致身体系统的功能失调。第三，某一种致畸因子会影响胎儿发展的某一特定方面。换言之，致畸因子不会伤害整个身体系统，其伤害是有选择性的。第四，致畸因子的影响有赖于剂量。少量的致畸因子并不会伤害胎儿，接触越多，伤害越大。第五，致畸因子的伤害未必明显地反映在孩子出生时，很可能是反映在以后的生活中；致畸因子的长期效应常常有赖于出生后的环境质量。第六，协同作用。多个消极因素一起出现，能加剧单个有害因子的消极影响。 胎儿的发育会受到多种因素的影响，而致畸因子对胎儿造成的伤害不是简单直接的，它取决于上述各种因素

致畸指数=母体LD／胎仔最小致畸作用剂量，＜10说明无致畸作用；10～100说明有致畸作用；>100说明具有强烈致畸作用。即致畸指数越大说明该化学物致畸作用越强。