依据《国务院关于预防煤矿生产安全事故的特别规定》，对被责令停产整顿的煤矿，颁发证照的部门应当（）其有关证照。

A项，煤矿有重大安全生产隐患和行为的，应当立即停止生产，排除隐患。煤矿安全监察部门要履行监督检查的职责，一旦发现重大安全生产隐患和违法行为，必须立即下达停产整顿的指令，提出整顿的内容、时间等具体要求。B项，3个月内2次或者2次以上发现有重大安全生产隐患，仍然进行生产的煤矿，县级以上人民政府负责煤矿安全生产监督的部门、煤矿安全监察机构应当提请有关人民政府关闭该煤矿。C项，被责令停产整顿的煤矿擅自从事生产的，县级以上地方人民政府负责煤矿安全监督管理的部门、煤矿安全监察机构应当提请有关地方人民政府予以关闭。D项，停产整顿的煤矿，在停产整顿期间，由有关人民政府采取有效措施进行监督检查。

依据《国务院关于预防煤矿生产安全事故的特别规定》第10条的规定，对3个月内2次或者2次以上发现有重大安全生产隐患，仍然进行生产的煤矿，县级以上地方人民政府负责煤矿安全生产监督管理的部门、煤矿安全监察机构应当提请有关地方人民政府关闭该煤矿(如A项)；第11条规定，被责令停产整顿的煤矿整改结束后，验收不合格的，由有关地方人民政府予以关闭(如D项)；被责令停产整顿的煤矿擅自从事生产的，县级以上地方人民政府负责煤矿安全生产监督管理的部门、煤矿安全监察机构应当提请有关地方人民政府予以关闭(如C项)；第5条规定，负责颁发采矿许可证、安全生产许可证、煤炭生产许可证、营业执照、矿长资格证、矿长安全资格证等证照的部门，一经发现煤矿无证照或者证照不全从事生产的，应当责令该煤矿立即停止生产，同时于2 Et内提请当地县级以上地方人民政府予以关闭(如E项)。

第十七条 县级以上地方人民政府负责煤矿安全生产监督管理的部门、煤矿安全 监察机构在监督检查中，1 个月内 3 次或者 3 次以上发现煤矿企业未依照国家有关规定对井下 作业人员进行安全生产教育和培训或者特种作业人员无证上岗的，应当提请有关地方人民政府 对该煤矿予以关闭。

经验收不合格的，由有关人民政府予以关闭；被责令停产整顿的煤矿擅自从事生产的，县级以上地方人民政府负责煤矿安全监督管理的部门、煤矿安全监察机构应当提请有关地方人民政府予以关闭。3个月内2次或者2次以上发现有重大安全生产隐患，仍然进行生产的煤矿，县级以上人民政府负责煤矿安全生产监督管理的部门、煤矿安全监察机构应当提请有关人民政府关闭该煤矿。1个月内3次或者3次以上发现煤矿企业未依照国家有关规定对井下作业人员进行安全生产教育和培训或者特种作业人员无证上岗的，应当提请有关地方人民政府对该煤矿予以关闭。

《关于预防煤矿生产安全事故的特别规定》明确了应予关闭的非法煤矿的4种情形:①无证照或者证照不全擅自生产的；②在3个月内2次或者2次以上发现有重大安全生产隐患的；③停产整顿期间擅自从事生产的；④经整顿验收不合格的。