企鹅：鸟：卵生动物（）A、药品：仪器：实验室B、狮子：犬科动物：哺乳动物C、金线菊：菊花：花D、白杨：杨树：落叶树

第一步，确定题型。
根据题干关联词“如果……那么……”等，确定为翻译推理。
第二步，翻译题干。
①B（?鸟）→A（哺乳动物）
②C（哺乳动物）或A（哺乳动物）
③B（?鸟）→D（?鱼）
④D（鱼）或E（?昆虫）
⑤E（?昆虫）→B（?鸟）
第三步，进行推理。
利用代入法解题。
代入A项：动物B不是鸟，是对①的“肯前”，根据“肯前必肯后”可以推出“A是哺乳动物”，根据题干要求所有动物都只能归属一种门类，则C一定不是哺乳动物，排除A项；
代入B项：动物A是哺乳动物，根据题干要求“所有动物都只能归属一种门类”，则C一定不是哺乳动物，排除B项；
代入C项：动物D不是鱼，是对③的“肯后”，根据“肯后不必然”无法推出其它，D不是鱼，是对④的或关系一支的否定，根据“否定肯定式”，得到E不是昆虫，根据⑤可得B不是鸟，根据①可得A是哺乳动物，A是哺乳动物，根据题干要求“所有动物都只能归属一种门类”，则C一定不是哺乳动物，排除C选项；
代入D项：动物E是昆虫，是对④的或关系一支的否定，根据“否定肯定式”，得到D是鱼，这是对③的“否后”，根据“否后必否前”可得B是鸟，这是对①的“否前”，否前可以得到可能性结论，即A可能不是哺乳动物，根据题干要求所有动物都只能归属一种门类，则C可能是哺乳动物，故该项可以得到“动物C是哺乳动物”。

“并非所有的鸟都是”的意思是“有的鸟不是”。所以选B项。